Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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