Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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NelfeP19426 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NelfeP19426 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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NelfeP19426 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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NelfeP19426 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NelfeP19426 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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