Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18524 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18524 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18524 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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