Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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