Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Hoxd4P10628 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Hoxd4P10628 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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