Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PdgfrbP05622 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PdgfrbP05622 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PdgfrbP05622 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfrbP05622 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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