Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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H2-Eb1P04230 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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