Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HbaP01942 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HbaP01942 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HbaP01942 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HbaP01942 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HbaP01942 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HbaP01942 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms