Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccl20O89093 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms