Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms