Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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