Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DffaO54786 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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