Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Foxd2O35392 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Foxd2O35392 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Foxd2O35392 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Foxd2O35392 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Foxd2O35392 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms