Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Casq1O09165 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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