Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4340L7N2C4 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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