Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Igbp1-201ENSMUST00000033570 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm42553-201ENSMUST00000196390 1629 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms