Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm2035J3QP87 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2035J3QP87 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms