Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34aG3UW52 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34aG3UW52 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms