Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmf1B9EKI3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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