Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NhsB1AV60 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms