Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Atp8b5A3FIN4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atp8b5A3FIN4 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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