Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn34c4A2ANA3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms