Protein–RNA interactions for Protein: A2AJT4

Pnisr, Arginine/serine-rich protein PNISR, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnisrA2AJT4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnisrA2AJT4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnisrA2AJT4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms