Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

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Length 1,818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Itgb4A2A863 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Itgb4A2A863 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Itgb4A2A863 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itgb4A2A863 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms