Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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