Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CcniQ9Z2V9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms