Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hdac5Q9Z2V6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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