Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Tgm1Q9JLF6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgm1Q9JLF6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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