Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnft1Q9DCN7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms