Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms