Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx20Q9D2Y5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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