Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Mrpl55Q9CZ83 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms