Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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