Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ddx28Q9CWT6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ddx28Q9CWT6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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