Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Smim8Q9CQQ0 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms