Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
DenrQ9CQJ6 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms