Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms