Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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