Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ms4a6dQ99N07 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms