Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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