Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms