Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp11Q99K46 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp11Q99K46 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp11Q99K46 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp11Q99K46 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp11Q99K46 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp11Q99K46 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp11Q99K46 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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