Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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