Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Smim11aQ99J19 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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