Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fbxo18Q8K2I9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Fbxo18Q8K2I9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms