Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms