Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 968.6 ms