Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Csnka2ipQ8CH19 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms