Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc28aQ8CEI3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccdc28aQ8CEI3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc28aQ8CEI3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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