Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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